تقوم إدارة البحوث الداخلية والخارجية بالإدارة العامة للبحوث العلمية بمتابعة اعلان وتنفيذ الجوائز الخاصة وهى كما يلى :-
ا- جائزة أ.د/ حسين ابو ليلة :
تنفيذ قرار مجلس الجامعة بجلسته المنعقدة فى 26/12/1994 عـلى تخصيـص جائزة سنوية بإسم أ.د / حسين أبو ليلة - الاستاذ بقسم الطبيعة بكلية العلوم جامعة قطر تمنح لصاحب احسن بحث منفرد يقوم به مدرس باحد اقسام الطبيعة بكليات (العلوم – البنات – التربية – الهندسة –الحاسبات والمعلومات ) وتقدر قيمة الجائزة بمبلغ 1000ج .
ب- جائزة أ.د/ لطيفة الحوطى:
تنفيذ قرار السيد أ.د/ رئيس الجامعة فى 26/2/1995 على إنشاء جائزة سنوية بإسم أ.د / لطيفة الحوطى تمنح لاحسن بحث منفرد فى مجال الفيزياء التجريبية يتقدم به استاذ مساعد بأقسام الطبيعة بكليات (العلوم – البنات – التربية – الهندسة –الحاسبات والمعلومات ) وتقدر قيمة الجائزة بمبلغ 1500ج .
ج- جائزة أ.د/ كريمات محمود السيد :
تنفيذ قرار مجلس الجامعة بجلسـته المنعقدة فى 29/3/2004 على إنشــاء جـائزة سنـوية بإسـم أ.د / كريمات محمود السيد – الاستاذ المتفرغ بقسم الفيزياء بكلية العلوم وتمنح لصاحب احسن بحث يقوم به مدرس من قسم الطبيعة من كليات الجامعة تخصص (بلورات) بكليات (العلوم- البنات – التربية) وتقدر قيمة الجائزة بمبلغ 1500ج .